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1.组织病理学检查：显示角质形成细胞和空心细胞的准确性为80-90％。
2.抗HPV衣壳抗原的免疫组化检测：用HPV免疫动物后产生的多克隆抗体用于检测HPV抗原常用的过氧化物酶抗过氧化物酶法以显示生殖器疣中的病毒蛋白。
3．基因诊断：
近年来发展起来的PCR方法具有特异性，敏感性，简便性和快速性的优点。它为HPV检测开辟了一条新途径。通过PCR方法检测HPV优于核酸杂交方法，灵敏度高。如果通过凝胶电泳直接进行GP-PCR方法，则分析的结果是，可以检测到样本中200个拷贝的HPV DNA。如果通过核酸杂交检测PCR产物，则灵敏度提高并且可检测到10个拷贝的HPV DNA。
DNA杂交方法：可以打印HPV DNA杂交技术，如PCK法，EGFR免疫染色法，CP14免疫染色法，杂交可检测到HPV-DNA相关序列，PCR检测显示特异性HPV-DNA扩增带。但麻烦而昂贵。
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需要一些设备和条件。
4.组织化学检查：将少量病变组织制成涂片并用人乳头瘤病毒特异性抗体染色。如果病毒抗原处于病变中，则抗原和抗体以过氧化物酶抗过氧化物酶（PAP）方法结合。
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可以染成红色。该方法具体而且快速，有助于诊断。
5.细胞学检查：巴氏涂片组织涂片进行诊断出两种细胞，即空泡化细胞和角质形成细胞。
6.局部试验方法：甲苯胺蓝试验用1％醋酸脱水后1％甲苯胺蓝涂片胴体或周围正常皮肤，癌症或尖锐湿疣患者仍可见染色阳性。
7.透射电子显微镜：可用阴道镜和放大镜检查25-45％末期角质形成细胞的阳性率。
8.阴道镜检查：待乙酸白试验辅助只要定期对医疗机构进行检测，一般比较准确。
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